爱康科技十大股东:RNA的提取方法步骤及原理.

来源:百度文库 编辑:中科新闻网 时间:2024/04/26 18:53:07

分子克隆技术(华农)

实验一 质粒的制备

质粒是携带外源基因进入细菌中扩增或表达的主要载体,它在基因操作中具有重要作用。质粒的分离与提取是最常用、最基本的实验技术。

质粒的提取方法很多,大多包括3个主要步骤:细菌的培养、细菌的收集和裂解、质粒DNA的分离和纯化。本实验以碱裂解法为例,介绍质粒的抽提过程。

实验目的:掌握碱裂解法抽提质粒的原理、步骤及各试剂的作用。

实验材料:含有质粒pUC18载体的大肠杆菌菌液,克隆有水稻外源片段的BAC的大肠杆菌菌液。

实验原理:在pH 12.0 ~ 12.6碱性环境中,细菌的线性大分子量染色体DNA变性分开,而共价闭环的质粒DNA虽然变性但仍处于拓扑缠绕状态。将pH调至中性并有高盐存在及低温的条件下,大部分染色体DNA、大分子量的RNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍然为可溶状态。通过离心,可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。

实验步骤:

1. 取含有pUC18质粒的大肠杆菌菌液于LA培养基上37℃过夜培养;

2. 用无菌牙签挑取单菌落,接种于含有Amp抗生素的LB培养基中,37℃摇床~250 r/min过夜培养;

3. 吸取1.5 ml菌液,12000 g离心2分钟,收集菌体,倒掉菌液;吸取1.5 ml菌液,再次收集菌体,尽量将菌液倒干净;

4. 加入300 ml溶液 I振荡打匀,重新悬浮细胞,震荡混匀(注意:应彻底打匀沉淀或碎块); (剧烈)

5. 加入300 ml溶液II,轻柔颠倒混匀,放置至清亮,一般不超过5分钟;

6. 加入300 ml溶液III颠倒混匀,放置于冰上10分钟,使杂质充分沉淀;(温和)

7. 12000 g离心10分钟;

8. 吸取800 ml上清液(注意:不要吸取到飘浮的杂质)至另一Eppendorf管中,加入2/3体积的异丙醇,室温下放置5分钟;

9. 12000 g 常温离心15分钟;

10. 倒尽上清,加75%乙醇浸洗除盐(放置片刻或离心3分钟后倒去上清);

11. 室温放置或超净台上风干DNA;

12. 加40 ml灭菌超纯水或TE溶解;

13. 质粒、BAC的质量检测,于-20℃保存。

附注:质粒检测

电泳检测:质粒电泳一般有三条带,分别为质粒的超螺旋、开环、线型三种构型

吸光值检测:采用分光光度计检测260nm、280nm波长吸光值,若吸光值260nm/280nm的比值介于1.7-1.9之间,说明质粒质量较好,1.8为最佳,低于1.8说明有蛋白质污染,大于1.8说明有RNA污染。

实验二 DNA的琼脂糖凝胶电泳

带电荷的物质在电场中的趋向运动称为电泳。电泳的种类多,应用非常广泛,它已成为分子生物学技术中分离生物大分子的重要手段。琼脂糖凝胶电泳由于其操作简单、快速、灵敏等优点,已成为分离和鉴定核酸的常用方法。

实验目的:掌握琼脂糖凝胶电泳的原理,学习琼脂糖凝胶电泳的操作。

实验材料:质粒DNA、BAC、植物总DNA

原理没找到,以下是方法和步骤。
总RNA(total RNA)和信使RNA(mRNA)的抽提
1、实验目的
提取人体细胞的总RNA和mRNA。

2、本实验所需试剂
1)、CNE-2细胞及培养细胞的一系列条件,
2)、PBS缓冲液, TRIZOL试剂,
3)、DEPC处理过的水、大、中、小Tip及1.5 ml EP管,
4)、新的氯仿、异丙醇和乙醇,
5)、mRNA分离试剂盒:Oligotex mRNA Mini Kit,Cat.no.:70022, QIAGEN。
6)、新配的电泳缓冲液,专跑RNA的琼脂糖(Agarose)。

3、实验流程(掌握内容)
3.1 细胞总RNA的提取
1)、6孔板细胞(CNE-2)汇合度为90-100%时,取出无菌室,去其上清,用PBS洗两次后,每孔加TRIZOL试剂(Gibco公司) 1 ml,摇匀,无菌罩内消化3-5分钟(观察:液体变粘稠,细胞脱壁)。
2)、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC处理过的1.5 ml EP管中,加新开的氯仿0.2 ml,轻摇15秒。
3)、室温静置2-3分钟后,12000 rpm,15 min,4℃,离心。然后取上清无色水相(约0.6 ml)到 EP管(DEPC处理过),加0.5 ml新开的异丙醇,室温下静置10分钟。
4)、12000 rpm,10分钟,4℃,离心。观察总RNA在管底的白色沉淀,弃去上清(小心别丢了沉淀),75%乙醇1.0 ml洗涤(用DEPC水新配制)后,7500 rpm,5 min,4℃离心。
5)、去上清,点离,用小Tip吸干液体。气干沉淀5-10分钟, DEPC处理水20-30 ul加入,中枪打匀,55-60℃水浴10分钟溶解总RNA,测OD值。
6)、电泳。

3.2 从总RNA中分离mRNA(Oligotex mRNA Mini Kit,Cat.no.:70022, QIAGEN)
1)、取上述提取的总RNA若干(少于0.25 mg)到一个新的无RNase 的EP管中,用无RNase的水定容到250 ul。
2)、加入Buffer OBB 250 ul, Oligotex Suspension 15 ul。用Tip打匀或用手弹匀。
3)、70℃水浴,3分钟(裂解RNA的二级结构)。
4)、20-30℃条件下,静置10分钟(让Oligotex与mRNA结合)。
5)、高速离心2分钟,小心吸走上清(该上清要保留),留下约50 ul的上清在原管里。
6)、用Buffer OW2 400 ul重悬含Oligotex/mRNA复合物的沉淀,然后将这些加到套有1.5 ml EP管的SPIN柱子上,高速离心1分钟。
7)、将SPIN柱子移到一个新的EP管上,加Buffer OW2 400 ul到柱子,高速离心1分钟,丢掉滤过液。
8)、将SPIN柱子移到一个新的EP管上,加20-100 ul热的(70℃)Buffer OEB到柱子上,用Tip来回吸打3-4次,高速离心1分钟。
9)、为保证最大的 mRNA产量,可再次重复第8步。
10)、电泳。

4、mRNA的应用(了解内容):
RT-PCR, Northern杂交,cDNA文库构建, mRNA末端快速扩增(RACE),差异表达(DDRT-PCR),引物延伸反应(Primer Extension),体外转录(In Vitro RNA Transcription), RNA标记(RNA labeling),RNA酶保护试验(RNase and S1 Nuclease Protection Assay),RNA微注射(RNA Microinjection)

动植物组织mRNA提取实验方法

作者:admin 来源:本站原创 2006-1-16

一、材料
水稻叶片或小鼠肝组织。
二、设备
研钵,冷冻台式高速离心机,低温冰箱,冷冻真空干燥器,紫外检测仪,电泳仪,电泳槽。
三、试剂
1、无RNA酶灭菌水:用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃ 2小时)装蒸馏水,然后加入0.01%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。
2、75%乙醇:用DEPC处理水配制75%乙醇,(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。
3、1×层析柱加样缓冲液;20mmol/L Tris·Cl(pH7.6),0.5mol/L NaCl,1mmol/L EDTA(pH8.0),0.1% SDS。
4、洗脱缓冲液:10mmol/L Tris·Cl (pH7.6),1mmol/L EDTA (pH8.0),0.05% SDS。
四、操作步骤
(一)动植物总RNA提取-Trizol法
Trizol法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫克至几克。用Trizol法提取的总RNA绝无蛋白和DNA污染。RNA可直接用于Northern斑点分析,斑点杂交, Poly(A)+分离,体外翻译,RNase封阻分析和分子克隆。
1、将组织在液N中磨成粉末后,再以50-100mg组织加入1ml Trizol液研磨,注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%。
2、研磨液室温放置5分钟,然后以每1mlTrizol液加入0.2ml的比例加入氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒。
3、取上层水相于一新的离心管,按每mlTrizol液加0.5ml异丙醇的比例加入异丙醇,室温放置10分钟,12000g离心10分钟。
4、弃去上清液,按每ml Trizol液加入至少1ml的比例加入75%乙醇,涡旋混匀,4℃下7500g离心5分钟。
5、小心弃去上清液,然后室温或真空干燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度。然后将RNA溶于水中,必要时可55℃-60℃水溶 10分钟。RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。
[注意] 1、整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。
2、加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在4℃保存一周,-20℃保存一年。

(二)mRNA提取
由于mRNA末端含有多poly(A)+,当总RNA流径oligo(dT)纤维素时,在高盐缓冲液作用下,mRNA被特异的吸附在oligo(dT)纤维素柱上,在低盐浓度或蒸馏水中,mRNA可被洗下,经过两次oligo(dT) 纤维素柱,可得到较纯的mRNA。
1、用0.1mol/L NaOH悬浮0.5-1.0g oligo(dT)纤维素。
2、将悬浮液装入灭菌的一次性层析柱中或装入填有经DEPC处理并经高压灭菌的玻璃棉的巴斯德吸管中,柱床体积为0.5-1.0ml,用3倍柱床体积的灭菌水冲洗柱床。
3、用1x柱层析加样缓冲液冲洗柱床,直到流出液的pH值小于8.0。
4、将(一)中提取的RNA液于65℃温育5分钟后迅速冷却至室温,加入等体积2x柱层析缓冲液,上样,立即用灭菌试管收集洗出液,当所有RNA溶液进入柱床后,加入1倍柱床体积的1x层析柱加样溶液。
5、测定每一管的OD260,当洗出液中OD为0时,加入2-3倍柱床体积的灭菌洗脱缓冲液,以1/3至1/2柱床体积分管收集洗脱液。
6、测定OD260,合并含有RNA的洗脱组分。
7、加入1/10体积的3M NaAc(pH5.2), 2.5倍体积的冰冷乙醇, 混匀, -20℃30分钟。
8、4℃下12000g离心15分钟,小心弃去上清液,用70%乙醇洗 涤沉淀,4℃下12000g离心5分钟。
9、小心弃去上清液,沉淀空气干燥10分钟,或真空干燥10分钟。
10、用少量水溶解RNA液,即可用于cDNA合成(或保存在70%乙醇中并贮存于-70℃)。
[注意] 1、mRNA在70%乙醇中-70℃可保存一年以上。
2、oligo(dT)纤维素柱用后可用0.3mol/l NaOH洗净,然后用层析柱加样缓冲液平衡,并加入0.02%叠氮钠(NaN3)冰箱保存,重复使用。每次用前需用NaOH水层析柱加样缓冲液依次淋洗柱床。

你可以看看《分子克隆》书上都有的。

国家实验室的攻关课题?不至于吧,楼上的。我们大学实验就有这个,提取酵母菌的RNA。楼主去买本北大出的《生物化学实验》,李健武著。里边有详细的操作步骤。
先写一个随手搜到的ppt
http://lab.swhospital.com/UploadFiles/2003617151741912.ppt

你要干什么.国家实验室的攻关课题你想在网上下啊.没有庞大的金钱和技术支持根本别想触及着方面.

RNA的提取,可以看看BIOG的,在操作上还是很简便的,具体如下:1. 请自行准备:无水乙醇、无RNA酶1.5mL离心管。2. 取出洗涤液,按以下操作:a) 洗涤液A:21mL加入9mL无水乙醇;35mL加入15mL无水乙醇;42mL加入18mL无水乙醇。b) 洗涤液B:9mL加入21mL无水乙醇;15mL加入35mL无水乙醇;18mL加入42mL无水乙醇。c) 配制好的洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。3. 取无RNA酶的1.5mL离心管,加入200μL样本,4μLRNA Carrier混合均匀,再加入300μL 裂解液及20μL 消化液,漩涡震荡10秒,充分混匀,56℃水浴10 分钟至完全裂解。4. 加入1000μL无水乙醇,轻轻颠倒混匀,如有半透明悬浮物,不影响RNA的提取与后续实验。5. 将吸附柱放入收集管内,将760μL上述溶液转入吸附柱内,静置2 分钟,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液.6. 将剩余760μL溶液转移至吸附柱内,重复步骤5。7. 将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液A至吸附柱内,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。8. 将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液B至吸附柱内,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。9. 将吸附柱放回收集管内,12,000 rpm 4℃离心2 分钟,离去残留的洗涤液。10. 取出吸附柱,放入新的无RNA酶的1.5 mL 离心管内,加入30-50μL 洗脱液,静置3 分钟,12,000 rpm 4℃ 离心2 分钟,收集RNA溶液。11. -70℃保存,或直接用于下一步实验。